Presidentti panee vireille ”Ghost Protocolin” ja Kremlin terroripommituksesta syytetyn IMF-agentin Ethan Huntin osaston toiminta lopetetaan. Ilman taustatukea tai apuvälineitä Ethanin täytyy puhdistaa osastonsa nimi ja estää uusi terrori-isku. Ethan joutuu suoriutumaan tehtävästä yhdessä IMF:stä eronneiden agenttien kanssa tietämättä täysin ryhmän motiiveja.
Susan Cooper raataa CIA:n kellarissa analyytikkona. Hänen tehtävänsä on huudella ohjeita hurmaavan agentin Bradley Finen korvanappiin, kun tämä niittää kentällä konnia halki poikki ja pinoon. Tämä hissukka konttorirotta on ihannoinut agenttien jännittävää työtä ja haaveillut todellisen vakoojan tehtävistä. Kun Bradley kuolee työtehtävissä, Susan saa tilaisuutensa ja pääsee kokeilemaan siipiään tositoimissa. Susan ilmoittautuu vapaaehtoiseksi vaaralliseen peitetehtävään, jossa hänen tulee soluttautua rikollisliigaan. Nyt on laitettava peliin kaikki teoriassa opittu ja yritettävä pysyä hengissä. Homma ei olekaan mikään läpihuutojuttu, sillä vastassa on kylmäverinen rikollispomo Rayna Boyanov, joka ei tunne armoa. Kaiken huipuksi itseään täynnä oleva idioottivakooja Rick Ford ei usko Susanin lahjoihin ja päättää hoitaa tehtävän omiin nimiinsä. Onneksi Susan saa avukseen vanhan kollegansa Nancy B. Artingstallin.
Nate Foster on nuori ja korkeasti koulutettu idealisti, jonka tehtävä on paljastaa ulkomaisia terroristeja. Nate pettyy huomatessaan, että monissa tapauksissa FBI vain houkuttelee yksittäisiä henkilöitä terroritekoon täyttääkseen kiintiöt ja rauhoitellakseen huolestuneita kansalaisia. Kun paljastuu, että maahan on salakuljetettu likaisissa pommeissa käytettävää cesium-137:ää, Nate tapaa agentti Angela Zamparon. Angela uskoo, että tekijät ovat amerikkalaisia uusnatseja. Nate ottaa askeleen tuntemattomaan ja yrittää soluttautua vaaralliseen uusnatsiryhmään, joka haluaa puhdistaa maan tappamalla ja tuhoamalla.
Koko elämäsi on rekisteröity tietokoneelle. Henkilötietosi. Rikosrekisterisi. Ja rahasi. Näin on tietysti myös Angela Bennettin laita - ja hän ei ollut aikaisemmin uhrannut ajatustakaan koko asialle - ennen kuin hänet pyyhittiin pois kaikista tiedostoista...
When CIA analyst Jack Ryan stumbles upon a suspicious series of bank transfers his search for answers pulls him from the safety of his desk job and catapults him into a deadly game of cat and mouse throughout Europe and the Middle East, with a rising terrorist figurehead preparing for a massive attack against the US and her allies.
