Videnskabsmanden Robert Neville er helt alene i storbyen efter at en dødbringende virus har udslettet resten af New Yorks befolkning. Han prøver desperat at komme i kontakt med andre overlevende ved hjælp af sin radio, men der er tilsyneladende ikke andre. I hvert fald ikke om dagen. Men om natten kommer de inficerede mutanter frem. Og de holder øje med Neville.
Et sælsomt syn møder drengen Pazu, da den jævnaldrende Sheeta langsomt daler ned fra himlen med en magisk amulet om halsen. Det viser sig, at både Pazu og Sheeta drømmer om at finde Laputa, det svævende slot. Den forældreløse Sheeta håber at finde sandheden om sin familie på Laputa, men regeringens agenter og en gruppe pirater er også på jagt efter det sagnomspundne slot.
Da NASA-direktør og tidligere astronaut Jo Fowler (Halle Berry) erfarer, at månen inden for kort tid vil blive slået ud af sin bane, og således føre til udslettelse af jorden og menneskeheden, tager hun en ukonventionel beslutning: Jo Fowley søger hjælp hos såvel en tidligere astronaut og en konspirationsteoretiker. Trods faren for eget liv begiver disse usandsynlige helte sig snart ud på en umulig sidste mission i rummet, kun for at opdage, at vores måne slet ikke er, hvad vi tror, den er...
På vegne af det britiske imperium drager en af verdens sidste store opdagelsesrejsende, britiske Percy Fawcett, i starten af det 20. århundrede til Amazonas jungle for at kortlægge området mellem Brasilien, Peru og Bolivia. I junglen finder han spor på en hidtil ukendt, højt udviklet civilisation. På trods af, at de etablerede videnskabsmænd latterliggør ham og hans tese om et teknisk avanceret urfolk i junglen, bliver udforskningen til en besættelse for ham. Han tager nu tilbage til regnskoven for at bevise, at han har ret.
Et team af videnskabsmænd, der arbejder på at rejse en sunket russisk atomubåd på en havplatform ud for Miamis kyst, Florida, afgraver et gammelt atlantisk levn fra havbunden og henter en ekspert til at finde ud af det. Men mens man forsøger at hæve ubåden, udløser radioaktiv lækage fra dens missler Atlantis' genopståen, og den resulterende flodbølge ødelægger platformen og efterlader kun en lille gruppe overlevende. Reddet af to Vietnamvetere, der er blevet tunge, og som er ude og slappe af efter deres seneste job, støder deres båd til sidst på grund på en caribisk ø i nærheden, hvor det, når de går i land, opdages, at alt er blevet ødelagt og alle dræbt. De skyldige, en ond gruppe af velbevæbnede raiders, og deres leder, Crystal Skull, er efterkommere af Atlantis' oprindelige race, der gik i gang med at generobre verden og tilføje de overlevende til listen over ofre, mens de kæmper for at holde sig i live og besejre raiders og sende Atlantis tilbage til havbunden.
